MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	A	6	6	14	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014749	ATATA	2	10	29	38	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014749	TTA	2	6	44	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014749	A	7	7	162	168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014749	ATTTT	2	10	217	226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014749	A	7	7	249	255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014749	GGA	2	6	372	377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014749	GTC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014749	GC	3	6	409	414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014749	T	6	6	483	488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014749	TCGC	2	8	490	497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014749	GTA	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014749	AT	3	6	526	531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014749	CTG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014749	CTG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014749	T	6	6	1070	1075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014749	TTA	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014749	TGA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014749	ATT	2	6	1381	1386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014749	TTTAC	2	10	1418	1427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014749	TTC	2	6	1432	1437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014749	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014749	AGA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014749	ACT	2	6	1516	1521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014749	TATGA	2	10	1546	1555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014749	AT	3	6	1602	1607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014749	ATC	3	9	1694	1702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014749	TC	3	6	1711	1716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014749	TCC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014749	CTTTT	2	10	1775	1784	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014749	CT	3	6	3584	3589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014749	CTC	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014749	T	6	6	7739	7744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014749	TAA	3	9	7869	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014749	GAT	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014749	ACTT	2	8	7914	7921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014749	TA	3	6	7926	7931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014749	A	6	6	7939	7944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014749	TTAT	2	8	8120	8127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014749	T	7	7	8127	8133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014749	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014749	CTATA	2	10	8166	8175	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014749	TTA	2	6	9807	9812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014749	TAG	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014749	ATA	2	6	9833	9838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014749	T	6	6	9888	9893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014749	TAAA	2	8	9905	9912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014749	TC	3	6	9941	9946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014749	T	6	6	9950	9955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014749	A	7	7	9993	9999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014749	ATT	2	6	10040	10045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014749	ATT	2	6	10050	10055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014749	AT	3	6	10059	10064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014749	TA	3	6	10067	10072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014749	TA	3	6	10084	10089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014749	A	6	6	10344	10349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014749	TAG	2	6	10428	10433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014749	TAAT	2	8	10438	10445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014749	GTA	2	6	10475	10480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014749	CAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014749	A	7	7	10502	10508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014749	AAAG	2	8	10514	10521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014749	AAT	2	6	10533	10538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014749	TTCC	2	8	10579	10586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014749	T	7	7	10588	10594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014749	T	7	7	10613	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014749	AAT	2	6	10754	10759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014749	AGA	2	6	10787	10792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014749	TG	3	6	10809	10814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014749	TGA	2	6	10822	10827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014749	TA	3	6	10860	10865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014749	TATG	2	8	10900	10907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014749	A	6	6	10909	10914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014749	TTAC	2	8	11102	11109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014749	TAT	2	6	11116	11121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014749	A	6	6	12790	12795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014749	ATT	2	6	12819	12824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014749	TAT	2	6	12836	12841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014749	A	6	6	14959	14964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014749	TA	3	6	14976	14981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014749	AGG	2	6	16515	16520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014749	GCT	2	6	17317	17322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014749	TA	3	6	17362	17367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014749	CTA	2	6	17452	17457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014749	GTA	2	6	17516	17521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014749	TTAT	2	8	17524	17531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014749	AGAA	2	8	17559	17566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014749	TTAC	2	8	17707	17714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014749	TAT	2	6	17721	17726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014749	A	7	7	18891	18897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014749	GATA	2	8	18931	18938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014749	A	6	6	18969	18974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014749	ATTC	2	8	18984	18991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014749	ATT	2	6	19091	19096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014749	T	8	8	19154	19161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014749	TTATTC	2	12	19239	19250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014749	TTC	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014749	A	6	6	19412	19417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014749	ATT	2	6	19689	19694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014749	AAT	2	6	19698	19703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014749	TAAT	2	8	19750	19757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014749	T	6	6	19763	19768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014749	CATG	2	8	19792	19799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014749	AATAT	2	10	19800	19809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014749	TTA	2	6	19818	19823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014749	GA	3	6	19842	19847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014749	T	6	6	19850	19855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014749	TA	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014749	TAC	2	6	19893	19898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014749	TAA	3	9	19907	19915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014749	TTGAT	2	10	20906	20915	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014749	ATT	2	6	21003	21008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014749	TAT	2	6	21018	21023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014749	A	6	6	21042	21047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014749	GAA	2	6	21084	21089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014749	TATATT	2	12	21093	21104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014749	GAA	2	6	21114	21119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014749	TTTC	2	8	21153	21160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014749	ATT	2	6	21185	21190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014749	GTT	2	6	21209	21214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014749	AAG	2	6	21225	21230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014749	TAA	2	6	21286	21291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014749	A	7	7	21367	21373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014749	GAC	2	6	21394	21399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014749	GATCTG	2	12	21400	21411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014749	GTA	2	6	21466	21471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014749	TGAT	2	8	21476	21483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014749	AT	3	6	21827	21832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014749	AAAT	2	8	21846	21853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014749	T	6	6	21894	21899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014749	ATCAA	2	10	21910	21919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014749	ACT	2	6	21923	21928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014749	GAT	2	6	21958	21963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014749	CTT	2	6	21967	21972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014749	TCAG	2	8	22017	22024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014749	TA	3	6	22120	22125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014749	ATG	2	6	22178	22183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014749	T	6	6	22232	22237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014749	ACAA	2	8	22261	22268	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014749	AGTGT	2	10	22300	22309	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014749	TTTGA	2	10	22333	22342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014749	GATT	2	8	22371	22378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014749	AGATA	2	10	22395	22404	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014749	GAA	2	6	22539	22544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014749	A	6	6	22663	22668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014749	TGGA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014749	GGTTT	2	10	24077	24086	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014749	CTA	2	6	24104	24109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014749	T	7	7	24201	24207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014749	TCC	2	6	24957	24962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_014749	CTA	2	6	24991	24996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014749	AAATTT	2	12	24997	25008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014749	ATTG	2	8	25042	25049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014749	T	6	6	25069	25074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014749	ATC	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_014749	AC	3	6	25104	25109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014749	AT	3	6	25168	25173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014749	ATC	2	6	25208	25213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014749	CTTC	2	8	25237	25244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_014749	TTTA	2	8	28614	28621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014749	TAT	4	12	28628	28639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014749	TTTAT	2	10	28659	28668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014749	GTA	2	6	28671	28676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014749	TA	3	6	28675	28680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014749	A	6	6	28795	28800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014749	ATT	2	6	28869	28874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014749	ATT	2	6	28918	28923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014749	AAG	2	6	28940	28945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014749	TCT	2	6	28952	28957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_014749	A	7	7	30687	30693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014749	A	7	7	30767	30773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014749	TTTC	2	8	30774	30781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_014749	T	6	6	30822	30827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014749	AGAT	2	8	30866	30873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014749	A	6	6	30903	30908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014749	A	7	7	30951	30957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014749	ATT	2	6	30959	30964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014749	A	6	6	30974	30979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_014749	CTA	2	6	31277	31282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_014749	TA	3	6	31336	31341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014749	AAT	2	6	31362	31367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014749	TATGT	2	10	31376	31385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014749	TAAT	2	8	31418	31425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014749	GTA	2	6	31455	31460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014749	A	6	6	31482	31487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014749	AGG	2	6	31496	31501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014749	A	6	6	32905	32910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014749	A	6	6	32915	32920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014749	A	7	7	32940	32946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_014749	T	7	7	32967	32973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014749	TTA	2	6	32982	32987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.